Postoje li sličnosti između proteinskih struktura kolagena i amiloida?

Oboje su entalpijski stabilizirani međumolekularnim vodikovim vezama (do neke mjere).

Amiloidna vlakna:

  • Kinetika stvaranja amiloida vrlo je složena. Postoji mnogo različitih mogućih struktura koje tvore agregati, u rasponu od unakrsne beta strukture, do raspoređenih konformacija do alfa-listova.
  • Svima im je zajedničko jedno, prisutnost plahti.
  • Pojedinačni se listovi stabiliziraju intramolekularnim H vezivanjem.
  • Tercijarna struktura stabilizirana je intermolekularnom H-vezom .
  • Sve najviše aminokiseline mogu biti prisutne u amiloidima.
  • Nema kovalentne veze između listova.

Kolagena vlakna:

  • Kolagena vlakna nastaju kovalentnim umrežavanjem kolagenih mikrofibrila kroz ostatke lizina. Organizacija mikrofibrila do fibrila različita je za različite vrste kolagena.
  • Mikrofibrile nastaju raspoređenim rasporedom kolagenih trostrukih spirala.
  • Trostruke zavojnice stabilizirane su intermolekularnim H vezama .

Slika: a i b su PDB strukture različitih kolagena. c i d prikazuju obrazac H-vezivanja.

  • Glicini, prolini, hidroksiprolini često su prisutni u kolagenovim strukturama
  • Prolini imaju krutu okosnicu, tj. Ograničene konformacije.
  • Više o presavijanju trostruke zavojnice: Odgovor Sai Jananija Ganesana na Što nukleira preklapanje trostruke zavojnice kolagena?

Mogu li se molekule kolagena agregirati i stvoriti amiloide?

  • Usprkos dugoj duljini i sporoj kinetici kolagena, oni gotovo nikada ne tvore agregate, tj. Nisu skloni amiloidogenezi.
  • Kolagen je bogat glicinom i prolinom. Obje ove aminokiseline ostaci su okretaja i nemaju visoku sklonost beta-listovima. Također, studije pokazuju da amiloidi imaju određeni prag prolin: glicin, a kolagen je daleko iznad te granice.

Referenca: Stranica na iop.org

Struktura i stabilnost kolagena.

Posljednje ažuriranje 09/12/2020

Komentiraj