Jesu li kolagen i elastin dobiveni iz riba ili goveda molekularno ili strukturno isti kao ljudski kolagen i elastin ili su različiti kolagen i elastin?

Oni su isti i različiti su, ovisno o tome koji kolagen gledate. Ali u cjelini, nevjerojatno su identični. Ono što to komplicira jest da postoji više gena za kolagen (i više gena za elastin, ali usredotočimo se samo na kolagen jer su koncepti isti).

Kolagen ima nekoliko vrsta i nalazi se u svim oblicima života, od spužvi, crva, muha, riba, krava i ljudi. Ako pogledamo SAMO JEDAN gen za kolaž - COL1A1 - nalazimo izvanrednu zaštitu. Ran sam BLAST funkcijeza usporedbu gena kolagena ljudski (Homo sapiens) , zebraste ribice (Danio rerio) i krava (Bos taurus) koji kodiraju oblik kolagena proteina koji stvara vlakna. Evo zaslona s rezultata. Prvo uspoređivanje krave s čovjekom:

To se nastavlja i nastavlja, poklapajući i poravnavajući 4.751 DNA DNA. Vidite zapis "Identiteti"? To je 100%. Geni krave i čovjeka COL1A1 identični su. Dalje, usporedba ribe s čovjekom:

To se nastavlja i nastavlja, poklapajući i poravnavajući 5.548 DNA DNA. Vidite zapis "Identiteti"? To je 100%. Geni zebra i ljudski COL1A1 identični su.

Dakle, prvi dio odgovora je za OVAJ tip fibrilarnog kolagena, oni su isti.

Ali drugi dio odgovora odnosi se na različite kolagene. Evo slike iz analize različitih gena kolagena koji kodiraju različite vrste kolagena kod ljudi . Ako pažljivo pogledate, vidjet ćete COL1A1, ali vidjet ćete i COL2,3,4,5,6,7,8,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19 , 20,21,22,23,24,26,27 i 28

( Izvor slike: Nassa M, Anand P, Jain A, Chhabra A, Jaiswal A, Malhotra U, Rani V. Analiza sekvenci humanog kolagena. Bioinformacije. 8 (1): 26-33. Doi: 10.6026 / 97320630008026. )

Bez prikazivanja stvarnih genskih sekvenci poredanih, ovo vam pokazuje stablo koliko su usko povezane genske sekvence. Dakle, na vrhu slike vidjet ćete da su COL1,2,3,5 i 11 prilično usko povezani u slijedu. Vrlo se razlikuje od njih skupina na dnu koja se sastoji od gena COL23 i 25.

Dakle, na ovoj razini, različiti geni kolagena mogu biti prilično slični ili prilično različiti UNUTAR ISTIH VRSTA.

Ali što ako usporedimo pogled na te gene pojedinačno i usporedimo ih među vrstama ... opet nalazimo izvanredan identitet

Slučajnim odabirom COL7A1, 10.436 bazne cDNA je 100% ista između riba i ljudi.

Pitanje je uključivalo kralježnjake (krave, ribe, ljude), ali kao što je navedeno, kolagene (i elastine) možemo pronaći u najranijim („primitivnim“) oblicima života, pa kako bi bilo da beskralješnjaci izgledaju poput voćnih muha ( Drosophila melanogaster )? Slučajno odabiremo gen za kolagen tipa IV COL4A1 ... evo poravnanja s ljudskim COL4A1:

100% identično. Neću pokušati pokrenuti sve ostalo. To možete učiniti sami s ovim ... Nukleotidni dom - NCBIi ovo ... Osnovni alat za pretraživanje lokalnog poravnanja

Posljednje ažuriranje 15/12/2020

Komentiraj